El Proyecto del Microbioma de la Tierra (The earth microbioma project)se fundó en el año 2010, y tenía como objetivo analizar las comunidades microbianas de todos los biomas del mundo. Fue un esfuerzo colaborativo entre distintas instituciones académicas y centros de investigación de distintos países; en el que participaron más de 500 investigadores.
Analizaron más de 27,000 muestras de 43 países, mediante secuenciación masiva de amplicones. Si quieres saber cómo se hace esto, revisa nuestros cursos virtuales y síguenos en nuestras redes sociales. Además, en una segunda fase del proyecto utilizaron técnicas de metagenómica y metabolómica.
En su sitio web, puedes encontrar los protocolos estandarizados de laboratorio que utilizaron para llevar a cabo el análisis, esto debido a que los investigadores notaron que la selección de la técnica de extracción de ADN, la región variable del 16S rRNA utilizado, la plataforma de secuenciación, la metodología de análisis bioinformático y base de datos seleccionadas, tienen una gran influencia en los resultados del análisis del microbioma de cualquier modelo de estudio; es decir, el microbioma de muestras que fueron tratadas con distintas metodologías son difícilmente comparables.
Si quieres saber más al respecto de cómo se hacen éstos análisis bioinformáticos, revisa nuestra lista de reproducción en you tube y los cursos virtuales que ofertamos.
En este proyecto se incluyeron muestras de suelo, heces humanas y de animales, piel, agua de mar y agua dulce, entre otras, además, buscaba ampliar el conocimiento que se tenía de la microbiota de biomas poco estudiados como las hormigas, cascarón de huevos de aves, sedimentos marinos contaminados, suelos de la Antártida, entre otros. Y como se mencionó anteriormente, para que los resultados pudiesen ser comparados, se utilizaron los mismos protocolos estandarizados en todas las muestras, incluyendo instalaciones definidas para la secuenciación con el fin de eliminar el sesgo causado por ésta variable.
En el sitio web del proyecto del microbioma de la Tierra, también puedes encontrar los resultados que obtuvieron a través de la lista de publicaciones, las tarjetas de reporte que resumen la información de los 10 microorganismos más abundantes en todas las muestras estudiadas, considerando su prevalencia en cada una y su abundancia con base en los parámetros ambientales, así como el microorganismo más abundante por cada bioma estudiado, además cuenta con un mapa interactivo en el cual puedes revisar los países que participaron en el proyecto con las respectivas muestras utilizadas.
También, construyeron una base de datos llamada QIITA donde puedes encontrar las secuencias y los archivos de los metadatos de cada muestra, donde invitan a que todo grupo de investigación que use sus protocolos estandarizados incluya su información.
Calendario de cursos de bionformática del microbioma
| Curso | Fechas | Horario (Ciudad de México) | Modalidad | Más información |
| QIIME 2 para principiantes | Puedes acceder a los videos durante 3 meses | asincrónico | Virtual | Consulta temario |
| QIIME 2 nivel intermedio | 2,9,16 y 23 noviembre 2024 | 9 am a 1 pm | Virtual-Zoom | Consulta temario |
| Workshop 16S rRNA | 22 a 24 de julio 2024 | 10 am a 6 pm | Presencial-Tlaxcala, México | Consulta temario |
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