Muestras de DNA
Construcción de bibliotecas y secuenciación de amplicones (MiSeq y/o PacBio)
Concentración: >2 ng/µL (preferentemente >10 ng/µL) cuantificado con fluorímetro Qubit™ o fluoroespectrómetro NanoDrop™ 3300
Volúmen: >20 µL de cada muestra por marcador molecular a amplificar
Pureza: relación 260/280 y 260/230 >2.0
Construcción de bibliotecas y secuenciación de metagenoma (NovaSeq)
Concentración: > 2 ng/µL (preferentemente > 10 ng/µL) cuantificado con fluorímetro Qubit™ o fluoroespectrómetro NanoDrop™ 3300
Volúmen: > 30 µL de cada muestra (preferentemente 50-100 µL)
Pureza: relación 260/280 y 260/230 > 2.0 muy importante ya que la construcción de bibliotecas es sensible a la calidad del DNA
Bibliotecas de amplicones elaborada por el cliente (MiSeq)
Biblioteca purificada: > 10 ng/µL cuantificado con fluorímetro Qubit™ o fluoroespectrómetro NanoDrop™ 3300
Volúmen: > 40 uL
Si usa primers personalizados, proporcione 10 µL de cada uno, i.e., Forward + Reverse + Index a 100 µM
Microbioma Lab verificará estos criterios de calidad y se reserva el derecho de rechazar el servicio si estos no se cumplen en las muestras enviadas por el cliente.
REQUERIMIENTOS DE ENVÍO
DNA en tubo de 1.5 mL
Cada muestra debe tener una clave identificadora única, legible y con tinta indeleble negra o azul.
Enviar una imagen del gel de electroforesis de las muestras de DNA.
Los tubos deben estar sellados con parafilm.
Enviar las muestras y solicitar al servicio de paquetería la leyenda de frágil.
Introducir en el paquete el código impreso de proyecto asignado.
Muestras ambientales
Las especificaciones para la colecta de muestras dependen de los métodos estandarizados por el cliente. Para el procesamiento de la extracción de DNA, se requiere lo siguiente:
Materia fecal, suelo, composta, biofertilizante sólido
Cantidad: > 500 mg en un tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC.
Saliva
Exudados con hisopos secos de rayón o dacrón estériles en un tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC.
Tejidos de plantas
Cantidad : > 500 mg de tejido en un tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC.
Agua
Filtros de 0.22 µ de nitrocelulosa almacenados en tubos de tapón de rosca individuales almacenado a -80ºC.
Biorreactor
Pellet celular en tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC
Tejidos de animales
Cantidad: > 200 mg en un tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC
Transportar las muestras en hieleras que contengan hielo seco o en su defecto bolsas refrigerantes o hielo con sal gruesa, indispensable que las muestras estén depositadas en tubos de tapón de rosca sellados con parafilm o en su defecto bolsas ziploc perfectamente selladas.
No agregar ningún agente estabilizador o reguladores.
Es muy importante que los hisopos no sean de algodón ni de mango de madera porque se puede extraer DNA de estos dos elementos y alterar los resultados.
Introducir el código impreso asignado al proyecto.
Microbioma Lab no se hace responsable de daños en la muestra durante su transporte.