Muestras de DNA

Construcción de bibliotecas y secuenciación de amplicones (MiSeq y/o PacBio)

Concentración: >2 ng/µL (preferentemente >10 ng/µL) cuantificado con fluorímetro Qubit™ o fluoroespectrómetro NanoDrop™ 3300

Volúmen: >20 µL de cada muestra por marcador molecular a amplificar

Pureza: relación 260/280 y 260/230 >2.0

Construcción de bibliotecas y secuenciación de metagenoma (NovaSeq)

Concentración: > 2 ng/µL (preferentemente > 10 ng/µL) cuantificado con fluorímetro Qubit™ o fluoroespectrómetro NanoDrop™ 3300

Volúmen: > 30 µL de cada muestra (preferentemente 50-100 µL)

Pureza: relación 260/280 y 260/230 > 2.0 muy importante ya que la construcción de bibliotecas es sensible a la calidad del DNA

Bibliotecas de amplicones elaborada por el cliente (MiSeq)

Biblioteca purificada: > 10 ng/µL cuantificado con fluorímetro Qubit™ o fluoroespectrómetro NanoDrop™ 3300

Volúmen: > 40 uL

Si usa primers personalizados, proporcione 10 µL de cada uno, i.e., Forward + Reverse + Index a 100 µM

Microbioma Lab verificará estos criterios de calidad y se reserva el derecho de rechazar el servicio si estos no se cumplen en las muestras enviadas por el cliente.

REQUERIMIENTOS DE ENVÍO

DNA en tubo de 1.5 mL

Cada muestra debe tener una clave identificadora única, legible y con tinta indeleble negra o azul.

Enviar una imagen del gel de electroforesis de las muestras de DNA.

Los tubos deben estar sellados con parafilm.

Enviar las muestras y solicitar al servicio de paquetería la leyenda de frágil.

Introducir en el paquete el código impreso de proyecto asignado.

Muestras ambientales

Las especificaciones para la colecta de muestras dependen de los métodos estandarizados por el cliente. Para el procesamiento de la extracción de DNA, se requiere lo siguiente:

Materia fecal, suelo, composta, biofertilizante sólido

Cantidad: > 500 mg en un tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC.

Saliva

Exudados con hisopos secos de rayón o dacrón estériles en un tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC.

Tejidos de plantas

Cantidad : > 500 mg de tejido en un tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC.

Agua

Filtros de 0.22 µ de nitrocelulosa almacenados en tubos de tapón de rosca individuales almacenado a -80ºC.

Biorreactor

Pellet celular en tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC

Tejidos de animales

Cantidad: > 200 mg en un tubo de tapón de rosca almacenado a -80ºC

Transportar las muestras en hieleras que contengan hielo seco o en su defecto bolsas refrigerantes o hielo con sal gruesa, indispensable que las muestras estén depositadas en tubos de tapón de rosca sellados con parafilm o en su defecto bolsas ziploc perfectamente selladas.

No agregar ningún agente estabilizador o reguladores.

Es muy importante que los hisopos no sean de algodón ni de mango de madera porque se puede extraer DNA de estos dos elementos y alterar los resultados.

Introducir el código impreso asignado al proyecto.

Microbioma Lab no se hace responsable de daños en la muestra durante su transporte.