Microbioma Lab es la solución a todas tus dudas de microbioma, somos una empresa mexicana que oferta cursos virtuales, análisis bioinformáticos de secuencias genéticas y consultorías en temas de secuenciación de nueva generación.
Calendario de cursos de bioinformática vigente
| Curso | Fechas | Horario (Ciudad de México) | Modalidad | Más información |
| QIIME 2 para principiantes | 01 a 05 abril 2024 | 9 am a 2 pm | Virtual-Zoom | Consulta temario |
| QIIME 2 nivel intermedio | 2,9,16 y 23 noviembre 2024 | 9 am a 1 pm | Virtual-Zoom | Consulta temario |
| Workshop 16S rRNA | 22 a 24 de julio 2024 | 10 am a 6 pm | Presencial-Tlaxcala, México | Consulta temario |
¿Quieres aprender de microbioma y bioinformática?
¡Estás en el sitio correcto!
Cursos de bioinformática disponibles
¿Buscas dónde hacer un análisis bioinformático en México?
En Microbioma lab realizamos análisis bioinformáticos de microbioma, es decir, análisis de genómica ambiental para la identificación de microorganismos, en suelo, sedimentos, agua (dulce y salada), heces, tejido animal y vegetal, hisopos, bioaerosoles, consorcios, biofertilizantes, suelo contaminado, etc., por medio de técnicas moleculares y de secuenciación de masiva (Next Generation Sequencing, NGS).
Ofrecemos dos tipos de análisis:
1) Análisis de “metabarcoding”, es decir, la identificación taxonómica de la comunidad de bacterias y/o hongos.
2) Análisis metagenómico, es decir, la identificación y anotación funcional de la comunidad microbiana (bacterias, arqueas, hongos y virus).
El análisis bioinformático de secuencias de amplicones del 16S rRNA o ITS incluye el control de calidad, el agrupamiento de OTUs (operational taxonomic units) o inferencia de las ASVs (amplicon sequence variants), la asignación taxonómica, distintas métricas de diversidad alfa y análisis multivariados de la diversidad beta. Las imágenes que entregamos son de una excelente calidad de tal forma que las puede utilizar para la publicación de tu artículo de investigación. Utilizamos QIIME2 y Rstudio para la realización de los análisis y elaboración de las gráficas.
Microbioma lab la empresa de análisis bioinformático en línea de México
Durante el análisis bioinformático es necesario tomar decisiones importantes para el mejor aprovechamiento de tus datos, te acompañamos en cada una de las etapas de la toma de estas elecciones, es decir, te presentamos las alternativas con los pros y contras de cada una de las rutas a seguir para que basados en los objetivos de tu estudio puedas escoger la mejor opción para tus resultados.
En Microbioma lab hacemos el análisis bioinformático de secuencias genéticas
Contamos con el equipo de cómputo adecuado y personal calificado con amplia experiencia en análisis de datos de secuenciación de nueva generación.
¿Tienes datos moleculares y buscas dónde hacer el análisis bioinformático en México?
¡Estas en el lugar correcto! En Microbioma Lab, la empresa mexicana de soluciones bioinformáticas para el análisis de datos de metagenómica los realizamos con ética, responsabilidad y la confianza de que tus datos están seguros.
Ya sea que nos compartas los archivos en formato fastq desde tu repositorio o te auxiliemos a descargarlos del servidor de servicios de terceros donde estén almacenadas.
Podemos analizar desde miles hasta millones de secuencias, a partir de tus lecturas crudas podemos decirte los géneros microbianos y su abundancia en tus muestras, las métricas de diversidad alpha como Simpson, Shanon, pielou_e y más; diversidad beta a través de parámetros como braycurtis, euclidean, diversidad filogenética y más.
Puedes comprar el servicio de análisis bioinformático básico del 16S rRNA o ITS donde te proporcionamos el informe de la calidad de tus secuencias, el informe de la inferencia de ASVs o agrupamiento de OTUs, informe del análisis del perfil taxonómico, las imágenes en formato JPG en calidad para publicación científica, archivos con todos los scripts usados durante el análisis bioinformático.
También puedes adquirir un análisis bioinformático personalizado, donde podemos ayudarte con esa figura que está solicitando un revisor o análisis más especializados como una correlación, un análisis de agrupamiento (ej. UPGMA), predicción funcional con Picrust o tax4fun.
Calendario de cursos de bioinformática vigente
| Curso | Fechas | Horario (Ciudad de México) | Modalidad | Más información |
| QIIME 2 para principiantes | Puedes acceder a los videos durante 3 meses | asincrónico | Virtual | Consulta temario |
| QIIME 2 nivel intermedio | 2,9,16 y 23 noviembre 2024 | 9 am a 1 pm | Virtual-Zoom | Consulta temario |
| Workshop 16S rRNA | 22 a 24 de julio 2024 | 10 am a 6 pm | Presencial-Tlaxcala, México | Consulta temario |
Cursos de bioinformática disponibles
Consultorías especializadas
¿Desconoces la metodología de laboratorio para hacer estudios de metagenómica y microbioma?
¡Aquí te asesoramos!
Ofrecemos consultorías para implementar las técnicas en tu laboratorio. La consultoría consiste en una sesión de 60 min donde resolveremos todas tus dudas en temas relacionados con metodologías de laboratorio para el estudio del microbioma a través de «metabarcoding» o secuenciación de amplicones y metagenómica.
La sesiones son vía virtual y te entregamos un informe con los puntos más importantes recabados durante la reunión, te garantizamos que quedarás satisfecho al término de la consultoría.
Si deseas implementar éstas técnicas en tu laboratorio te podemos asesorar en cuestiones de equipos que se necesiten comprar, reactivos indispensables para la construcción de bibliotecas de amplicones, la metodología estandarizada de laboratorio, los primers que puedes utilizar, que plataforma de secuenciación masiva es la más recomendable para los proyectos que desarrollas en tu laboratorio.
Microbioma Lab es una empresa conformada por investigadoras altamente especializadas en análisis de microbioma en diferentes muestras ambientales. Ofrecemos consultorías personalizadas de acuerdo a las necesidades del cliente, desde cómo implementar las técnicas en su laboratorio y conocer paso a paso el flujo de análisis de microbioma de su modelo de estudio.
¿Dónde hacer la secuenciación de ADN en México?
Si en tu laboratorio no cuentan con el equipo necesario para la construcción de las librerías de secuenciación masiva, en Microbioma Lab te podemos ayudar, ya sea que nos envíes tu muestra y realicemos desde la extracción del ADN, la construcción de las bibliotecas y/o la secuenciación masiva.
El proceso consiste en tres etapas principales:
1) Extracción de ADN total a partir de muestras ambientales.
2) La construcción de las bibliotecas del ADN para secuenciación.
3) Secuenciación masiva en la plataforma de tu elección (Illumina MiSeq 300 paired end, Illumina NovaSeq 6000 PE150 o PacBio Sequel2).
Si tienes duda de cuál es la plataforma de secuenciación que más se adecúa a tus necesidades, a través de nuestro sistema de consultorías te podemos asesorar.
¿Por qué adquirir los servicios de secuenciación en Microbioma Lab?
Porque somos una empresa comprometida con la calidad y la puntualidad, además de un acompañamiento cercano con el cliente, así en cada etapa del proceso le informaremos de los avances para que usted pueda sentirse seguro de la entrega de sus archivos de secuencias.
Además a través del sistema de consultorías te podemos asesorar en la selección de la plataforma de secuenciación masiva adecuada para el barcode molecular y objetivos del estudio que está realizando.
Servicio de secuenciación en México a un excelente precio
Microbioma lab siempre al atento a las necesidades de nuestros clientes, respondemos tus mensajes y te proporcionamos las cotizaciones necesarias sin compromiso.
Microbioma lab es la website en México donde encuentras el servicio de metagenoma a un excelente precio
El estudio del microbioma se ha incrementado exponencialmente en la última década. Desde el punto de vista académico, el número de artículos publicados en revistas internacionales indizadas localizadas en el buscador Pubmed del NCBI aumentó de 375 en el 2006 (un año después de la comercialización de la pirosecuenciación, primer método de secuenciación masiva) a 20,615 durante el año 2020.
El término metagenómica, utilizado también para referirse al estudio del microbioma, se acrecentó de 101 artículos en el año 2006 a 3,721 durante el 2020. En el caso de México, el estudio del microbioma entre la comunidad científica también ha proliferado un 930%, pasando de tres artículos en el año 2006 a 280 durante el 2020 con un plus de 66 relacionados con el término metagenómica, por lo que en Microbioma lab estamos consientes de que los científicos nos encontramos en:
«La era del microbioma»
El estudio del microbioma en México por lo tanto está en voga, tal es el caso que en el año 2018 se organizó el primer Congreso Nacional de Microbioma, un evento de periodicidad bianual, en el cual investigadores de diferentes Instituciones académicas y de investigación del país, se reunieron para intercambiar ideas de este tema que está en desarrollo y del cuál aún falta mucho por conocer. Entre los hallazgos del Congreso Nacional de Microbioma del 2018, se encontró que más del 90% de los líderes de grupos que desarrollan investigaciones en torno al microbioma se encuentran localizados en Ciudad de México y área metropolitana. Sin embargo, para el evento realizado en el 2020, acudieron investigadores del interior de la república, de estados como Morelos, Guanajuato, Chiapas, Yucatán, entre otros.
Microbioma lab proporciona el servicio de análisis de metagenoma en cualquier parte de México como Aguascalientes, Coahuila, Guerrero, Guanajuato, Oaxaca, Querétaro y más, escríbenos.
Microbioma Lab está ubicado en la ciudad de Tlaxcala y ofrece sus servicios a nivel nacional.
Adicionalmente, como resultado de los avances científicos, se ha encontrado que el microbioma tiene gran relevancia en muchos de los procesos que ocurren tanto en el ambiente como en el ser humano, de tal manera que en el año 2007 se fundaron los proyectos internacionales del Microbioma Humano y tan sólo dos años después el de Microbioma de la Tierra y debido a todos los resultados relevantes derivados de estos grandes proyectos, entre otros, en el año 2018 se declaró el 27 de junio como el día mundial del microbioma.
Cursos de bioinformática disponibles
En Microbioma lab hacemos el podemos hacer el análisis del microbioma intestinal o cualquier otra muestra ambiental.
Así es, podemos realizar todo el proceso del análisis, desde las extracción del ADN de tus muestras hasta el análisis bioinformático, donde te entregamos los gráficos en la calidad adecuada para tu publicación.
Podemos analizar desde una hasta más de 100 muestras, tenemos flexibilidad en métodos de pago y tiempos de entrega, te acompañamos y asesoramos para que te sientas seguro durante todo el proceso.
Subimos tus secuencias al GenBank de NCBI
Para publicar en revistas científicas indexadas es necesario que tus secuencias estén disponibles en repositorios públicos. Preparar los archivos y subir las secuencias a los servidores puede consumir tiempo, en Microbioma lab subimos las secuencias por ti.
Microbioma lab se encarga de abrir tu cuenta en el NBCI en caso de que no la tengas o ingresar desde tu cuenta, apoyarte a recuperar tu contraseña en caso de que no la tengas, hacer el registro del Bioproject y Biosamples, apoyarte para elaborar la tabla SRA de metadatos con la información de tus muestras, obtener los archivos de secuencias en el formato que solicita el GenBabk y subirlas.
Hacemos todo el proceso hasta entregarte el número de acceso necesario para la publicación del artículo científico.
En nuestro canal de youtube puedes ver tutoriales del análisis bioinformático totalmente gratis
Contamos con más de 50 videos de temas de bioinformática, linux, Rstudio, vocabulario útil en estudios de microbioma, tutorial para utilizar QIIME2 e instalarlo en tu equipo de cómputo, todo en español y guiándote paso a paso si estás comenzando en bioinformática.
Aplicamos tecnologías de Next Generation Sequencing como Illumina Miseq en México
Opiniones de nuestros clientes
«Me gusto mucho la organización, el material que nos proporcionaron y la capacidad de explicar los temas de las diferentes doctoras»
«Me gustó mucho el curso, la asesoría fue excelente, ¡muchas gracias!»
«La explicación fue sencilla, la atención personalizada y el seguimiento paso a paso»
«La explicación de los fundamentos de asignación taxonómica, el material claro y la buena disposición y actitud de las ponentes»
«Me agrado mucho poder analizar mis propios archivos fastq, recibir una atención personalizada por parte de las instructoras durante el workshop y la guía para ir aprendiendo paso por paso a realizar los comandos y obtener resultados»
«Lo que más me gusto del Workshop fue: La atención y dedicación que tuvieron las instructoras, el tiempo que se le dedicó al curso (fue suficiente, no se pudo haber realizado en menos tiempo) y que haya sido presencial, creo que eso permitió que todo haya sido más fluido y ayudó al aprendizaje»
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| QIIME 2 nivel intermedio | 2,9,16 y 23 noviembre 2024 | 9 am a 1 pm | Virtual-Zoom | Consulta temario |
| Workshop 16S rRNA | 22 a 24 de julio 2024 | 10 am a 6 pm | Presencial-Tlaxcala, México | Consulta temario |
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Proyecto microbioma de la Tierra
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